Monday, August 22, 2005
Monday, August 15, 2005
Wizard Inheritance
นักวิทยาศาสตร์จากออสเตรเลีย (Royal children hospital, Victoria, Australia) พยายามเอาแฮรี่ พอตเตอร์มาสอนเด็กให้รู้จักพันธุศาสตร์
เพราะเขาบอกว่าจากเนื้อเรื่องของแฮรี่ พอตเตอร์ พ่อมดเป็นชนกลุ่มน้อยที่แอบปะปนอยู่ในกลุ่มมักเกิ้ล(ผู้ไม่มีเวทย์มนต์)
ทีนี้ สิ่งที่น่าสนใจก็คือพ่อมดแม่มดจะเป็นชนชาติใดก็ได้ อาจจะเป็นลูกหลานของผู้วิเศษหรืออาจจะเป็นลูกหลานของพวกมักเกิ้ล หรืออาจจะเป็นลูกครึ่งที่เรียกว่า half blood ก็ได้เช่นกัน
ลองมาดูการวิเคราะห์ของเขากันครับ
เขาว่าคุณสมบัติผู้วิเศษ(Wizarding abitily) จะสืบทอดต่อกันทางพันธุกรรมตามกฎของเมนเดล (บาทหลวงปลูกถั่วอ่ะ)
ทีนี้ ถ้าจำบทเรียนเรื่องเมนเดลกับถั่วลันเตาลือชื่อของแกได้จะรู้ว่าแกใช้สี ลักษณะผิวเมล็ดและลักษณะอื่นๆ ของถั่วของแกในการคิดเกี่ยวกับการถ่ายทอดทางพันธุกรรม
อ้าวแล้วทีนี้ ลักษณะอย่างหนึ่ง (เราเีรียกฟีโนไทป์) ก็ขึ้นกับตำแหน่งบนโครโมโซมที่เรียกว่าอัลลีล
หรือพูดง่ายๆ ก็คือยีนนั่นแหละ
เอาล่ะ ทีนี้พูดกันง่ายๆ ก็คือไอ้เจ้ายีนที่ว่าเนี่ยมันก็มียีนเด่นกับยีนด้อย
คนหนึ่งคนจะมียีนเนี่ยอยู่สองก๊อปปี้ อันนึงมาจากพ่อและอีกอันมาจากแม่
ขอแค่มียีนเด่นแค่ก๊อปปี้เดียว คนนั้นหรือไอ้ตัวนั้นก็จะแสดงลักษณะเด่นออกมา
เอาล่ะ ทีนี้เจ้าคุณสมบัติของผู้วิเศษเนี่ยมันเป็นยีนเด่นหรือยีนด้อยกันครับ?
คำตอบก็คือยีนด้อย
ทำไมล่ะ?
ก็ลองคิดดูสิครับ
ถ้า Wizard allele (W) เป็นถูกข่มด้วยลักษณะเด่นของ Muggle allele (M)
อย่างที่บอกไว้ข้างต้นว่าทุกคนมีสองก๊อปปี้
อันนึงจากสเปิร์มของพ่อ (W or M) และจากไข่ของแม่ (W or M)
เพราะงั้น permutation ที่จะเป็นไปไ้ด้ก็จะมี
W (sperm) + W (egg) = WW
W (egg) + M (sperm) = WM
W (sperm) + M (egg) = WM
M (sperm) + M (egg) = MM
ถ้า M (muggle = dominant หรือยีนเด่น) และ W (wizard = recessive หรือยีนด้อย)
ทั้ง WM และ MM ก็จะกลายเป็นมักเกิ้ลทั้งหมด
ในขณะที่ WW จะกลายเป็นผู้วิเศษ
จากสมมติฐานนี้ จะได้ว่า
Ron Weasley, Neville Longbottom และ Drago Malfoy เป็นพ่อมดเลือดแท้ที่มาจากสายเลือดพ่อมดทั้งหมด
หมายความว่าพ่อแม่ของวิสลีย์ ลองบัตท่อมและมัลฟอย มียีน WW ทั้งหมด เพราะงั้นทั้งสามคนก็เลยมียีนเหมือนกันคือ WW ทั้งหมดเลยกลายเป็นพ่อมด
แฮรี่ ถึงแม้ว่าทั้งพ่อและแม่จะเป็นพ่อมด (WW ทั้งคู่) แต่แม่ของแฮรี่เิกิดในตระกูลของมักเกิ้ล ซึ่งหมายความว่าคุณตาและคุณยายของแฮรี่เป็น WM ทั้งคู่ เพราะงั้นทั้งตาและยายของแฮรี่จึงเป็นมักเกิ้ลในขณะที่คุณแม่ของแฮรี่ได้รับยีนด้อยมาจากทั้งสองคนคือ WW จึงกลายเป็นผู้วิเศษ
เฮอไมโอนี่ ก็อยู่ในกลุ่มเดียวกับแม่ของแฮรี่ซึ่งก็เกิดมาจากมักเกิ้ลเหมือนกัน แต่เป็นมักเกิ้ลที่เป็น WM ทั้งคู่ เฮอไมโอนี่เลยได้ WW มาเลยกลายเป็นผู้วิเศษไป
ทีนี้ ในกรณีของซีมัส เพื่อนอีกคนของแฮรี่ ซึ่งเป็นเลือด half blood มีพ่อแม่เป็น WW และ WM เลยกลายมาเป็นผู้วิเศษเหมือนกัน
แต่ก็มีข้อที่น่าสนใจอย่างเช่น เนวิล ลองบัตท่อมที่ไม่ค่อยจะเก่งในเรื่องของพ่อมดแม่มดเท่าไรทั้งๆ ที่เกิดในตระกูลพ่อมดแม่มดหรือพวก Squib ที่แม้จะเกิดในตระกูลพ่อมดแม่มดแต่ไม่มีึความสามารถของผู้วิเศษอาจจะเกิดจากการกลายพันธุ์ในยีน WW ที่เขามีทำให้สูญเสียหรือทำให้แอคติวิตี้ของยีน (ที่ทำให้เป็นผู้วิเศษ) ลดลงไปก็ได้
ผมอ่านแล้ว นิยมในความคิดของการนำเรื่องราวที่เด็กสนใจมาช่วยทำให้การเรียนรู้ทางวิทยาศาสตร์ดีขึ้น
(เมื่อไรครูไทยจะทำได้งี้มั่งเนีย?)
Ref :
Jeffrey M. Craig, Renee Dow and MaryAnne Aitken, Harry Potter and the recessive allele Nature 436, 776 (11 August 2005)
เพราะเขาบอกว่าจากเนื้อเรื่องของแฮรี่ พอตเตอร์ พ่อมดเป็นชนกลุ่มน้อยที่แอบปะปนอยู่ในกลุ่มมักเกิ้ล(ผู้ไม่มีเวทย์มนต์)
ทีนี้ สิ่งที่น่าสนใจก็คือพ่อมดแม่มดจะเป็นชนชาติใดก็ได้ อาจจะเป็นลูกหลานของผู้วิเศษหรืออาจจะเป็นลูกหลานของพวกมักเกิ้ล หรืออาจจะเป็นลูกครึ่งที่เรียกว่า half blood ก็ได้เช่นกัน
ลองมาดูการวิเคราะห์ของเขากันครับ
เขาว่าคุณสมบัติผู้วิเศษ(Wizarding abitily) จะสืบทอดต่อกันทางพันธุกรรมตามกฎของเมนเดล (บาทหลวงปลูกถั่วอ่ะ)
ทีนี้ ถ้าจำบทเรียนเรื่องเมนเดลกับถั่วลันเตาลือชื่อของแกได้จะรู้ว่าแกใช้สี ลักษณะผิวเมล็ดและลักษณะอื่นๆ ของถั่วของแกในการคิดเกี่ยวกับการถ่ายทอดทางพันธุกรรม
อ้าวแล้วทีนี้ ลักษณะอย่างหนึ่ง (เราเีรียกฟีโนไทป์) ก็ขึ้นกับตำแหน่งบนโครโมโซมที่เรียกว่าอัลลีล
หรือพูดง่ายๆ ก็คือยีนนั่นแหละ
เอาล่ะ ทีนี้พูดกันง่ายๆ ก็คือไอ้เจ้ายีนที่ว่าเนี่ยมันก็มียีนเด่นกับยีนด้อย
คนหนึ่งคนจะมียีนเนี่ยอยู่สองก๊อปปี้ อันนึงมาจากพ่อและอีกอันมาจากแม่
ขอแค่มียีนเด่นแค่ก๊อปปี้เดียว คนนั้นหรือไอ้ตัวนั้นก็จะแสดงลักษณะเด่นออกมา
เอาล่ะ ทีนี้เจ้าคุณสมบัติของผู้วิเศษเนี่ยมันเป็นยีนเด่นหรือยีนด้อยกันครับ?
คำตอบก็คือยีนด้อย
ทำไมล่ะ?
ก็ลองคิดดูสิครับ
ถ้า Wizard allele (W) เป็นถูกข่มด้วยลักษณะเด่นของ Muggle allele (M)
อย่างที่บอกไว้ข้างต้นว่าทุกคนมีสองก๊อปปี้
อันนึงจากสเปิร์มของพ่อ (W or M) และจากไข่ของแม่ (W or M)
เพราะงั้น permutation ที่จะเป็นไปไ้ด้ก็จะมี
W (sperm) + W (egg) = WW
W (egg) + M (sperm) = WM
W (sperm) + M (egg) = WM
M (sperm) + M (egg) = MM
ถ้า M (muggle = dominant หรือยีนเด่น) และ W (wizard = recessive หรือยีนด้อย)
ทั้ง WM และ MM ก็จะกลายเป็นมักเกิ้ลทั้งหมด
ในขณะที่ WW จะกลายเป็นผู้วิเศษ
จากสมมติฐานนี้ จะได้ว่า
Ron Weasley, Neville Longbottom และ Drago Malfoy เป็นพ่อมดเลือดแท้ที่มาจากสายเลือดพ่อมดทั้งหมด
หมายความว่าพ่อแม่ของวิสลีย์ ลองบัตท่อมและมัลฟอย มียีน WW ทั้งหมด เพราะงั้นทั้งสามคนก็เลยมียีนเหมือนกันคือ WW ทั้งหมดเลยกลายเป็นพ่อมด
แฮรี่ ถึงแม้ว่าทั้งพ่อและแม่จะเป็นพ่อมด (WW ทั้งคู่) แต่แม่ของแฮรี่เิกิดในตระกูลของมักเกิ้ล ซึ่งหมายความว่าคุณตาและคุณยายของแฮรี่เป็น WM ทั้งคู่ เพราะงั้นทั้งตาและยายของแฮรี่จึงเป็นมักเกิ้ลในขณะที่คุณแม่ของแฮรี่ได้รับยีนด้อยมาจากทั้งสองคนคือ WW จึงกลายเป็นผู้วิเศษ
เฮอไมโอนี่ ก็อยู่ในกลุ่มเดียวกับแม่ของแฮรี่ซึ่งก็เกิดมาจากมักเกิ้ลเหมือนกัน แต่เป็นมักเกิ้ลที่เป็น WM ทั้งคู่ เฮอไมโอนี่เลยได้ WW มาเลยกลายเป็นผู้วิเศษไป
ทีนี้ ในกรณีของซีมัส เพื่อนอีกคนของแฮรี่ ซึ่งเป็นเลือด half blood มีพ่อแม่เป็น WW และ WM เลยกลายมาเป็นผู้วิเศษเหมือนกัน
แต่ก็มีข้อที่น่าสนใจอย่างเช่น เนวิล ลองบัตท่อมที่ไม่ค่อยจะเก่งในเรื่องของพ่อมดแม่มดเท่าไรทั้งๆ ที่เกิดในตระกูลพ่อมดแม่มดหรือพวก Squib ที่แม้จะเกิดในตระกูลพ่อมดแม่มดแต่ไม่มีึความสามารถของผู้วิเศษอาจจะเกิดจากการกลายพันธุ์ในยีน WW ที่เขามีทำให้สูญเสียหรือทำให้แอคติวิตี้ของยีน (ที่ทำให้เป็นผู้วิเศษ) ลดลงไปก็ได้
ผมอ่านแล้ว นิยมในความคิดของการนำเรื่องราวที่เด็กสนใจมาช่วยทำให้การเรียนรู้ทางวิทยาศาสตร์ดีขึ้น
(เมื่อไรครูไทยจะทำได้งี้มั่งเนีย?)
Ref :
Jeffrey M. Craig, Renee Dow and MaryAnne Aitken, Harry Potter and the recessive allele Nature 436, 776 (11 August 2005)
Saturday, August 13, 2005
Another Flat Earthism?
The Darwinism, theory that is more like a core of the evolutionary biology where most of the tenets in the field have been relied on for more than 150 years, is now being ruined from a group of christian scientists who believe in supernatural creation or so-called "intelligent design" aka ID. Why ?? because the darwinism is contradict to what bible says about god creation.
Despite many strong evidences and experiments supporting modern evolution theory, Many extreme arguments is still being raised against it. What are their arguments?
Some scientists or activists, as someone called them, had tried to illustrate the unlikeliness of evolutionary biology by calculating probability and possibility of the development of such a complex system like an eye. Of course, finally they concluded that it is implausible that the natural complex system like eye could indeed be developed from such a really simple system like chemical mixing and evolutionary stuffs without guiding from some supernatural intelligence or what they call "designer". Mere mutations and natural selections would not be enough to accomplish that level of intricacy. However, such calculation has not been published in any general accepted peer-review journal.
Well! then another question arises "where are the designer from?" ... No answer has been made for now !!
Another argument would be "Do we have enough information to precisely calculate the probability of an eye development like that they claimed they do? if not will we be able to use this calculation as a reference?". At least, Harvard professor of mathematics and evolutionary biology, Martin Nowak doesn't think that according to knowledge we have so far, it would not be feasible to accurately predict the probability of an eye came about hence this calculation seems wacky.
Well! There is no conclusion at this point. As a matter of actual fact, many people try to correlate this 2 theory together. At the same time, many try to support either one of them. Unfortunately, many just have fun watching the conflicts as for amusing themselves after work T_T.
One may ask what should we believe? Well IMO, at this point I do believe in the evolution theory because there are more evidences indicating its validity. And there is an inevitable Achilles's heel of intelligent design which is there is no way to neither conduct the experiment supporting the idea nor to proof it. Moreover, there are plenty of evidences supporting the evolution theory and many more to come!
Why is this quacky issue is matter?.. The point is what side should the school teach children? Should they talk about god creation or not talking about it at all.
As for me, I found this topic interesting because I don't see the point where the argument should be originated from anyway. Why don't they just simply add all of the reasons supporting both sides in to the curriculum so that the kids get to know both theory and they can finally use their own judgement to evaluate which one they want to believe.
The flat earthism idea can still be taught in school together with the sphere model of earth by Galileo Galilei. The Copernicus hypothesis also have been taught without any problem with the idea of earth is a center of the universe! Well!! the funny part is that they believe that there are turtles carrying earth.
Well! Anyway, theory can be replace by the new if in case there is some other strong evidences are discovered! All we need to do is just open our mind and we will do just fine ..
don't you think ?
More info :
1. Claudia Wallis, The Evolution wars from TIME magazine Issue August 15, 2005
2. http://en.wikipedia.org/wiki/Intelligent_design
3. http://www.discovery.org
4. http://www.talkorigins.org/faqs/darwinism.html
5. many books about dawin's theory
Despite many strong evidences and experiments supporting modern evolution theory, Many extreme arguments is still being raised against it. What are their arguments?
Some scientists or activists, as someone called them, had tried to illustrate the unlikeliness of evolutionary biology by calculating probability and possibility of the development of such a complex system like an eye. Of course, finally they concluded that it is implausible that the natural complex system like eye could indeed be developed from such a really simple system like chemical mixing and evolutionary stuffs without guiding from some supernatural intelligence or what they call "designer". Mere mutations and natural selections would not be enough to accomplish that level of intricacy. However, such calculation has not been published in any general accepted peer-review journal.
Well! then another question arises "where are the designer from?" ... No answer has been made for now !!
Another argument would be "Do we have enough information to precisely calculate the probability of an eye development like that they claimed they do? if not will we be able to use this calculation as a reference?". At least, Harvard professor of mathematics and evolutionary biology, Martin Nowak doesn't think that according to knowledge we have so far, it would not be feasible to accurately predict the probability of an eye came about hence this calculation seems wacky.
Well! There is no conclusion at this point. As a matter of actual fact, many people try to correlate this 2 theory together. At the same time, many try to support either one of them. Unfortunately, many just have fun watching the conflicts as for amusing themselves after work T_T.
One may ask what should we believe? Well IMO, at this point I do believe in the evolution theory because there are more evidences indicating its validity. And there is an inevitable Achilles's heel of intelligent design which is there is no way to neither conduct the experiment supporting the idea nor to proof it. Moreover, there are plenty of evidences supporting the evolution theory and many more to come!
Why is this quacky issue is matter?.. The point is what side should the school teach children? Should they talk about god creation or not talking about it at all.
As for me, I found this topic interesting because I don't see the point where the argument should be originated from anyway. Why don't they just simply add all of the reasons supporting both sides in to the curriculum so that the kids get to know both theory and they can finally use their own judgement to evaluate which one they want to believe.
The flat earthism idea can still be taught in school together with the sphere model of earth by Galileo Galilei. The Copernicus hypothesis also have been taught without any problem with the idea of earth is a center of the universe! Well!! the funny part is that they believe that there are turtles carrying earth.
Well! Anyway, theory can be replace by the new if in case there is some other strong evidences are discovered! All we need to do is just open our mind and we will do just fine ..
don't you think ?
More info :
1. Claudia Wallis, The Evolution wars from TIME magazine Issue August 15, 2005
2. http://en.wikipedia.org/wiki/Intelligent_design
3. http://www.discovery.org
4. http://www.talkorigins.org/faqs/darwinism.html
5. many books about dawin's theory
Tuesday, August 09, 2005
Math Lesson
Unbelievable, I have been struggling with basic mathematic like probability and stuff. It seems that it is important to me to learn all these things if I really want to pursue my career in the field of Biophysics. I cannot avoid studying it anymore no matter how much I hate calculation.
Well! It has been a long time since my last math course. I have not been making much progress for my study. Indeed, I am not productive at all.
After 3 days of excruciating study! I have finished the first chapter in a book so-called “Molecular Driving Forces” and have started to think more reasonable. At least, that is what I feel (optimistically). Anyway, I surely got some gist of what probability is and how important it is in Statistical mechanics calculation of biological system.
so pathetic, isnt it?
Friday, July 22, 2005
Streptavidin rocks again!
Streptavidin is one of the most well understood ligand-protein binding complex. It is naturally composed of 4 separate chains arranged into 2 dimers. The attempt to make a stable single chain dimer of streptavidin for amendability to phage and chip display has long remained unsuccessful because of the streptavidin binding site is made up of portions of both dimers therefore when the tetrameric complex is disrupted, the biotin binding pocket is lost.
Charle Cantor and his group in Boston University, MA just discovered a really interesting story about the mutant streptavidin dimer in that despite significant reduction in biotin binding affinity, the mutant is able to bind B4F (biotin-4-fluorescein) at 100000-fold higher than the ability to bind biotin.
Moreover, though the B4F binding is at a very high affinity, it is reversible unlike the traditional streptavidin-biotin system that binds very tightly so that draconean condition will be required for releasing of biotin.
Reference:
- Allison D, Nature Methods 2005 July 22;2(8):573
- Aslan FM, Yu Y, Mohr SC, Cantor CR.,Proc Natl Acad Sci USA. 2005 Jun 14;102(24):8507-12.
Tuesday, July 19, 2005
some more interesting stuff
http://www.sciencemag.org/sciext/125th/
http://www.biomachina.org/
http://www.ub.rug.nl/eldoc/dis/science/
http://www.ph.tn.tudelft.nl/Courses/FIP/noframes/fip-Contents.html
http://nramm.scripps.edu/
http://nramm.scripps.edu/seminars/2003/cryoem/lectures/
http://www.yaleglobal.yale.edu/
http://www.yaleinsider.org/
http://us.expasy.org/
http://saturn.med.nyu.edu/research/sb/stokeslab/image-analysis.html
http://its.med.yale.edu/software/mac/powerpoint_files/logo_listings2.html
http://partners.adobe.com/public/developer/opentype/afdko/topic_feature_file_syntax.html#1
http://www.biomachina.org/
http://www.ub.rug.nl/eldoc/dis/science/
http://www.ph.tn.tudelft.nl/Courses/FIP/noframes/fip-Contents.html
http://nramm.scripps.edu/
http://nramm.scripps.edu/seminars/2003/cryoem/lectures/
http://www.yaleglobal.yale.edu/
http://www.yaleinsider.org/
http://us.expasy.org/
http://saturn.med.nyu.edu/research/sb/stokeslab/image-analysis.html
http://its.med.yale.edu/software/mac/powerpoint_files/logo_listings2.html
http://partners.adobe.com/public/developer/opentype/afdko/topic_feature_file_syntax.html#1
Wednesday, July 13, 2005
Cyberman
After a long period of terrible insomnia. Today I have had a damn good rest all day.
I start writing an article in Thai again about the Cyborg. Indeed, It is such a pain in the ass to do something I haven't done for at least 5 years.
Cybernetic organism is something really interesting. I never know that this technology exists in a matter of 30 years by a pioneer in the field of wearable computer and, of course, cybernetics, Steve Mann, after the term was coined by Manfred E Clynes and Nathan Kline in 1960 in the NASA human space exploration.
Mann start wearing his machine 25 years ago and he live his life with it most of the time. In 2002, he was confiscated by the airport security in Canada and was enforced to remove his cybernetic setup. By which, He was having problem with nausea and many symptoms so he had to board on the wheelchair like a handicap. It is pretty obvious that he has integrated himself to the technology far too intimately and far too long. Therefore he, ultimately, cannot endure separating from it anymore.
Mann's invention is actually really interesting. His eyetap is capable to freeze moving object like wheel of running car or rotating propeller of a plane. Moreover it can record still image of what he is looking at at his whim.Stopping object from moving gives him an opportunity to have better face and detail recognition as well as ability to see something he cannot visualize clearly with his natural eyes. His wearable computer ,in addition, augments his remembrance by giving him extra-memory where he can access it anytime he would want to when it is attached to his body.
Well! Even though some people think he is just another blasphemist who is trying to enhance his ability to against god, he is still continue doing his amazing and extraordinary works and hope that one day it might change the way of our life to the better direction.
I start writing an article in Thai again about the Cyborg. Indeed, It is such a pain in the ass to do something I haven't done for at least 5 years.
Cybernetic organism is something really interesting. I never know that this technology exists in a matter of 30 years by a pioneer in the field of wearable computer and, of course, cybernetics, Steve Mann, after the term was coined by Manfred E Clynes and Nathan Kline in 1960 in the NASA human space exploration.
Mann start wearing his machine 25 years ago and he live his life with it most of the time. In 2002, he was confiscated by the airport security in Canada and was enforced to remove his cybernetic setup. By which, He was having problem with nausea and many symptoms so he had to board on the wheelchair like a handicap. It is pretty obvious that he has integrated himself to the technology far too intimately and far too long. Therefore he, ultimately, cannot endure separating from it anymore.
Mann's invention is actually really interesting. His eyetap is capable to freeze moving object like wheel of running car or rotating propeller of a plane. Moreover it can record still image of what he is looking at at his whim.Stopping object from moving gives him an opportunity to have better face and detail recognition as well as ability to see something he cannot visualize clearly with his natural eyes. His wearable computer ,in addition, augments his remembrance by giving him extra-memory where he can access it anytime he would want to when it is attached to his body.
Well! Even though some people think he is just another blasphemist who is trying to enhance his ability to against god, he is still continue doing his amazing and extraordinary works and hope that one day it might change the way of our life to the better direction.
Subscribe to:
Comments (Atom)